Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM15Q9C019 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms