Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA5Q9BWX5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms