Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms