Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms