Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 277.2 ms