Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms