Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP3Q96DZ5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms