Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C18orf8Q96DM3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms