Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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