Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.3 ms