Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms