Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CDO1Q16878 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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