Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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