Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms