Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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