Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPRHQ149N8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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