Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IHHQ14623 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IHHQ14623 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.4 ms