Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms