Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EFR3AQ14156 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms