Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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