Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190 ms