Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CNTN1Q12860 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CNTN1Q12860 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CNTN1Q12860 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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