Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms