Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms