Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms