Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CSNK2BP67870 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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