Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms