Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASP4P49662 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms