Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDF5P43026 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms