Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZEB1P37275 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms