Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms