Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGP37231 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPARGP37231 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPARGP37231 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPARGP37231 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGP37231 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms