Protein–RNA interactions for Protein: P35218

CA5A, Carbonic anhydrase 5A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA5AP35218 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CA5AP35218 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CA5AP35218 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CA5AP35218 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CA5AP35218 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CA5AP35218 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CA5AP35218 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CA5AP35218 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CA5AP35218 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CA5AP35218 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CA5AP35218 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CA5AP35218 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CA5AP35218 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CA5AP35218 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CA5AP35218 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CA5AP35218 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CA5AP35218 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CA5AP35218 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CA5AP35218 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms