Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2P22307 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2P22307 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2P22307 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2P22307 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2P22307 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2P22307 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2P22307 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2P22307 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2P22307 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2P22307 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2P22307 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2P22307 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2P22307 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2P22307 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCP2P22307 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms