Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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