Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms