Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

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Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4BP0C0L5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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