Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms