Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms