Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms