Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms