Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms