Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms