Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms