Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
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