Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBE1Q9UJT0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms