Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms