Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX1-2Q9UD57 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms