Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KCMF1Q9P0J7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms