Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms